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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
09/12/2019 |
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Data da última atualização: |
09/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. |
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Afiliação: |
SULIMARY O. GOMES; ISIS G. B. SOUZA; MICHELLI F. SANTOS; GEICE R. SILVA; MARC ALBRECHT; ALAN S. MCKINLEY; PAUL BENTZEN; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
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Título: |
Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019. |
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DOI: |
doi:10.1093/jcbiol/ruy115 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean |
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Palavras-Chave: |
Blue land crab; Caranguejo azul; Cardisoma guanhumi; Conservation; Diversidade genética; Molecular markers; NGS technology. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Caranguejo; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Crabs; Florida; Genetic markers; Molecular genetics; Population dynamics; Population genetics; Population structure; Puerto Rico. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02398naa a2200433 a 4500
001 2116375
005 2019-12-09
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adoi:10.1093/jcbiol/ruy115$2DOI
100 1 $aGOMES, S. O.
245 $aDiscovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda$bBrachyura: Gecarcinidae).$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aAbstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean
650 $aCrabs
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650 $aMolecular genetics
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700 1 $aSOUZA, I. G. B.
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700 1 $aMCKINLEY, A. S.
700 1 $aBENTZEN, P.
700 1 $aDINIZ, F. M.
773 $tJournal of Crustacean Biology$gv. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Registro |
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| Registros recuperados : 36 | |
| 7. |  | GOMES, S. O.; MENDES, R. F. de M.; LIMA, P. S. da C. Repetibilidade de marcadores ISSR em acessos de pinhão-manso. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 5.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 8., 2012, Salvador. Biodiesel, inovação e desenvolvimento regional: anais, trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2012. p. 357-358| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 8. | | MENDES, R. F. de M.; GOMES, S. O.; LIMA, P. S. da C. Reprodutibilidade de marcadores ISSR em pinhão-manso. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 5.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 8., 2012, Salvador. Biodiesel, inovação e desenvolvimento regional: anais, trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2012. p. 365-366| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 9. | | SANTOS, M. F.; SOUZA, I. G. B.; GOMES, S. O.; SILVA, G. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of microsatellite markers in the spiny lobster, Panulirus echinatus Smith, 1869 (Decapoda: Palinuridae) by Illumina MiSeq sequencing. Journal of Genetics, v. 97, Online resources, p. e25-e30, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 10. | | NASCIMENTO, M. do P. S. C. B.; GOMES, S. O.; ROCHA, S. M. B.; RIBEIRO, V. Q. Rebrota de leguminosas arbóreas do banco de germoplasma de forrageiras da Embrapa Meio-Norte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 383| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 11. | | SOUZA, V. A. B. de; SOUSA, J. P. B.; COSTA, M. do P. S. D.; GUIMARÃES, A. R. C.; VALE, E. de M.; GOMES, S. O. Características de frutos de híbridos do Programa de Melhoramento de Manga da Embrapa Meio-Norte. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | GOMES, S. O.; SOUZA, V. A. B. de; COSTA, M. do P. S. D.; SILVA, C. C. P. da; VALE, E. de M. Características físicas e químicas de acessos de cajui (Anacardium ssp.). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 60.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 32.; ERBOT - ENCONTRO REGIONAL DE BOTÂNICOS - MG, BA , ES, 29., 2009, Feira de Santana. Botânica brasileira: futuro e compromissos. Feira de Santana: SBB: UEFS, 2009. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 13. | | SOUSA, C. C.; GOMES, S. O.; LOPES, A. C. A.; GOMES, R. L. F.; BRITTO, F. B.; LIMA, P. S. C.; VALENTE, S. E. S. Comparison of methods to isolate DNA from Caesalpinia ferrea. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 2, p. 4486-4493, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 14. | | VIANA, J. P. G.; GOMES, S. O.; LOPES, A. C. de A.; GOMES, R. L. F.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. dos S. Comparação de seis métodos de extração de DNA genômico em babaçu. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 5 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 15. | | LUZ, G. de A.; LEITE, K. de S.; GOMES, S. O.; ARAUJO NETO, R. B. de; NASCIMENTO, M. do P. S. C. B.; LIMA, P. S. da C. Diversidade genética entre acessos de Camaratuba (Cratylia argentea (Desv.) Kuntze) com marcadores ISSR. In: WORKSHOP SOBRE TOLERÂNCIA ESTRESSES ABIÓTICOS, 1., 2013, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. p. 86-93. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 199).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 16. | | SOUZA, V. A. B. de; VALE, E. de M.; GOMES, S. O.; COSTA, M. do P. S. D.; GUIMARÃES, A. R. C. Efeito da concentração de sacarose na germinação in vitro do pólen de cinco acessos de bacurizeiro (Platonia insignis Mart.). Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 35, n. 3, p. 677-684, set. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 17. | | GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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| 18. | | LIMA, A. T. B.; SOUZA, V. A. B. de; GOMES, S. O.; SANTOS, M. F. dos; SOUZA, I. G. de B.; LIMA, P. S. da C. Otimização de reação e seleção de primers RAPD para estudo de variabilidade genética em Spondias mombin L. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 4 p. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 19. | | LUZ, G. A.; GOMES, S. O.; ARAUJO NETO, R. B. de; NASCIMENTO, M. S. C. B.; LIMA, P. S. da C. Molecular characterization of accessions of Cratylia argentea (Camaratuba) using ISSR markers. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 4, p. 15242-15248, nov. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 20. | | LUZ, G. de A.; LEITE, K. de S.; GOMES, S. O.; ARAUJO NETO, R. B. de; NASCIMENTO, M. do P. S. C. B.; LIMA, P. S. da C. Similaridade genética entre acessos do banco de germoplasma de Camaratuba (Cratylia argentea) baseada em marcadores ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 5 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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